הדוח הארוך פורש לאורך 80 עמודיו את מסכת המינויים הפוליטיים של מי שהיה בין ינואר 2001 למרץ 2003 השר לאיכות הסביבה. גולדברג קובע שהנגבי מינה עשרות מחברי מרכז הליכוד ובני משפחותיהם לתפקידים במשרדו, "תוך העדפת אינטרסים פוליטיים-אישיים על פני האינטרס הציבורי", כלשון הדו"ח.

לדוגמה, 43 מתוך 50 מועמדים לתפקידי פיקוח במשטרה הירוקה היו חברי מרכז ליכוד או בני משפחותיהם ולשבעה מתוך 10 העובדים שהתקבלו לעבודה, הייתה זיקה פוליטית לשר.

הניסוח החריף של הדו"ח לא מותיר ספק לגבי אחריותו הישירה של הנגבי לליקויים. גולדברג כתב כי הנגבי "רמס ברגל גסה את החוק ואת כללי המנהל התקין". עוד כתב כי "שר המעדיף שיקולים פוליטיים-אישיים על-פני ענייני המשרד שהוא מופקד עליו - מועל באמון הציבור. שר העושה שימוש במשאבי המשרד כדי להיטיב עם מקורביו, פוגע בעניין שנמסר לידיו כנאמן הציבור. במשטר דמוקרטי, שר מייצג כלפי המשרד שבראשו הוא עומד את צורכי כלל הציבור. שר המייצג את רצונו ואת צרכיו שלו, או את צורכיהם של מקורבים פוליטיים, פוגע בכלל הציבור".

ח"כ יוסי שריד אשר כיהן בעבר כשר לאיכות הסביבה, אמר בתגובה לדו"ח מבקר המדינה על המינויים הפוליטיים במשרד כי "ממצאי הדו"ח חמורים ביותר והם מחזירים לצחי הנגבי את המוניטין המפוקפק שלו כאיש חסר מעצורים". "על הממצאים האלה אסור לעבור לסדר היום, והיועץ המשפטי לממשלה חייב להעביר אותם לחקירה משטרתית, אלא אם החליט היועץ שלא לטפל בעבירות של פוליטיקאים רמי דרג", אמר שריד.

ד"ר דב חנין, יו"ר ארגון "חיים וסביבה", ארגון הגג של ארגוני הסביבה, קרא היום לשר הנגבי לקחת אחריות ולהתפטר מתפקידו, בעקבות הדברים הקשים והחד משמעיים הנאמרים נגדו בדו"ח מבקר המדינה. לדברי ד"ר חנין, אסור לעבור לסדר היום על הפיכת השירות הציבורי לנחלה פרטית ופוליטית ובסיס למינוי מקורבים לעמדות מפתח. "טענותינו הקשות, שהועלו עוד בזמן כהונתו של הנגבי, בדבר נחשול של מינויים פוליטיים במשרד לאיכות הסביבה, אושרו היום בדו"ח המבקר. אנו חוששים כי למשרד נגרם נזק קשה, וחיוני לפעול במהירות לשיקומו. אנו מביעים דאגה עמוקה מהפגיעה בתפקוד המשרד עקב המינויים הפוליטיים וכניסת שיקולים זרים לעבודת המשרד" אומר ד"ר חנין.

מהתנועה לאיכות השלטון נמסר כי אנשי התנועה לומדים את הדוח וההנהלה תחליט בימים הקרובים אם לפנות ליועץ המשפטי לממשלה בדרישה לפתוח בחקירה משטרתית והאם לפנות לנציב שירות המדינה בדרישה לנקוט באמצעים משמעתיים כלפי עובדי מדינה השותפים למינויים בניגוד להוראות התקשיר.