נהגי מכוניות באילת מחו היום נגד החלטת הממשלה לבטל את הפטור ממע"מ באילת. בתגובה לכך אומר משרד האוצר כי "אין הצדקה לתת הטבה של קרוב לכחצי מיליארד ₪ בשנה לעיר עם שיעור אבטלה נמוך, תעסוקה גבוהה ורמה חברתית-כלכלית גבוהה מהממוצע באזורי פריפריה.

במהלך 20 שנות יישומו של חוק אזור סחר חופשי באילת ניתנו לעיר הטבות מצטברות של למעלה מ- 10 מיליארד ₪. הממשלה החליטה על ביטול הפטור במטרה להרחיב את בסיס המס כדי לצמצם עיוותים ואפליות במערכת המס ולהסיט את המקורות שיתפנו לטובת הורדת מיסים לכלל הציבור.

הטבת המע"מ ניתנה לעיר אילת לפני שנים רבות כאשר מצבה של העיר אילת היה שונה בתכלית. על פי פרסומי הלשכה המרכזית לסטטיסטיקה מצבה החברתי-כלכלי של העיר אילת כיום, טוב לא רק בהשוואה לאזורי פריפריה אלא גם בהשוואה לערים במרכז הארץ. לפיכך, בתקופה כזו, אין סיבה להמשיך במתן הטבות לאילת כאשר ישובים פריפריה אחרים נמצאים במצב קשה בהרבה ונזקקים לסיוע יותר מהעיר אילת.
מעמדה של העיר כמוקד משיכה לתיירות הפנים איתן, ולראיה בשנת 2003 נרשם באילת מספר הלינות של ישראלים הגבוה ביותר מאז ומעולם. לעניין הירידה בתיירות החוץ הרי שאילת אינה שונה בעניין זה מערים אחרות בישראל, שכן התיירים ממילא לא משלמים מע"מ" לשון הודעת משרד האוצר.