כתבנו חגי הוברמן מוסר כי אתר האינטרנט של הג'יהאד האיסלמי אולץ להפסיק לפעול בסיוע חברות מארה"ב לפני כשלוש שנים, בפברואר 2003. כתוצאה מכך הוא עבר לפעול מאיראן, מה שהבטיח את פעילותו הרציפה של האתר. אולם בבדיקה שערך מרכז המידע למודיעין ולטרור בדצמבר 2005, כעדכון לבדיקה קודמת שהתקיימה באוגוסט 2004, הסתבר כי האירגון, מנהל חמישה אתרי אינטרנט מובילים המסתייעים בחמש ספקיות שירותי אינטרנט. שתי חברות הן בארה"ב, חברה באיראן, חברה ברומניה וחברה במלזיה.

אתרי האינטרנט משמשים עבור הג'יהאד האיסלמי אמצעי חשוב להפצת מסרי טרור ושנאה, במיוחד על רקע המגבלות המוטלות על פירסומי הארגון בתקשורת הממסדית של הרשות הפלשתינית.

מספר האתרים המשמשים את הארגון אינו קבוע וחדשות לבקרים נסגרים אתרים ונפתחים אתרים חדשים, בעיקר כתוצאה מלחצים המופעלים על החברות ספקיות השירותים. לעיתים נפתחים האתרים
תחת אותו שם אבל בסיוע של חברות ספקיות אינטרנט שונות או שהם נפתחים תחת שם אחר.
הג'יהאד-האיסלמי מודע ללחצים המופעלים על החברות ספקיות שירותי האינטרנט, בעיקר האמריקניות, ועל מנת להתגבר עליהם הוא נוהג להחליף את החברות הספקיות, הגם שעד כה לא פסקה הסתייעותו בחברות אמריקניות.

כתבנו מוסיף כי אתר qudsnews.net המופעל בעזרת ספקית אינטרנט מלוס-אנג'לס הינו אחד האתרים הרשמיים של הג'יהאד האיסלאמי. הוא חדש יחסית כולל חדשות המתעדכנות באופן שוטף, מאמרים של ראשי הארגון, תמונות של מחבלים מתאבדים והסתה לטרור. באתר קישורים לאתרים נוספים של הארגון ולביטאונים הרשמיים של הארגון. באתר ערוץ ששמו "אלשהדאא' אלאחיאא" ("השהידים החיים") ובו תמונות ודברי שבח ל"שהידים". באתר התפרסם לאחרונה ראיון עם זיאד
אלנח'אלה, סגן מזכ"ל האירגון, בו הוא קורא להקמת "חזית התנגדות" (קרי, חזית מאוחדת של ארגוני טרור), אשר "תנהל סיבוב נוסף של פעולות "התנגדות", כלומר, פעולות טרור, כדי להביס את
האויב".

גם אתר האינטרנט shikaki.net הוא אתר רשמי של הג'יהאד האיסלמי המוקדש לזכר מייסד ומנהיג הארגון פתחי שקאקי שמצא את מותו במלטה. האתר כולל תיעוד של פעילותו והתבטאויותיו של שקאקי והוא דומה מאד בתכניו לאתר של רמצ'אן שלח. זהו אתר מילולי בעיקרו. גם אתר זה הפסיק לפעול באוגוסט 2004. לאחרונה חזר לפעילות תוך הסתייעות בספקית אינטרנט אמריקנית.

לאחרונה פירסמה לשכת ההסברה של הג'יהאד האיסלמי הודעה בה היא מדווחת על סגירת אתר האינטרנט של מזכ"ל התנועה רמדאן שלח, במסגרת מה שהיא מכנה "קמפיין ציוני-אמריקני".
מבדיקה שנערכה באגף המודיעין של צה"ל מתברר כי האתר אכן הפסיק לפעול באותה עת לתקופת מה, אולם הוא שב לפעילות בסיוע של חברה רומנית המספקת שירותי אכסון.

במהלך הבדיקה עלו שלושה שמות המוגדרים כ"אנשי קשר טכניים" הפועלים מביירות (עבדאללה רמדאן, כמאל אבו עיד ומחמד חידר). ייתכן אפוא, אך הדבר עדיין דורש אימות, שגם הג'יהאד האיסלמי, כמו החמאס, מפעיל את תשתית האינטרנט שלו מבירות, באכוונת הנהגתו שבדמשק.

בשנה האחרונה פועל הארגון, המסתייע באיראן ובסוריה, באופן רצוף לטירפוד ה"הרגעה" ולהביא להסלמה בעימות האלים עם ישראל. במסגרת זאת, ביצע הארגון, מאז תחילת 2005, שורה של
פעולות התאבדות קטלניות בתל אביב, בחדרה ובנתניה (בה היו שתי פעולות התאבדות), בהן נהרגו 21 אזרחים ונפצעו כ-160 .

בדומה לחמאס ולארגוני טרור אחרים, פלשתיניים ובין-לאומיים, עושה גם הג'יהאד האיסלמי שימוש נרחב באינטרנט, הגם שתשתית אתרי האינטרנט שלו נופלת ברמתה, באיכותה הטכנית ובהיקף
תפוצתה מזו של החמאס.
עוד מציין כתבנו, כי בניגוד לחמאס, המפנה את המסרים שלו לקהלי יעד מגוונים ברחבי העולם (בשבע שפות שונות), מתמקד "הג'יהאד האיסלמי בפלשתין" בקהל היעד הפלשתיני ובקהלים קוראי ערבית בלבד.

באמצעות האתרים מעבירה ההנהגה בדמשק את מסריה המדיניים וההסברתיים ליש"ע. כמו כן ועברים באמצעי זה גם הנחיות לפעילי הטרור של התנועה.