אמש התפרסם דו"ח ארגון השמאל הקיצוני "יש דין" בו נטען כי משטרת ש"י נכשלת בחקירתם של 90% מהתלונות המוגשות נגד מתנחלים "אלימים". החקירות עפ"י הדו"ח מסתיימות בדרך כלל ללא איתור חשודים או ללא שהחוקרים הצליחו לגבש ראיות מספיקות להגשת כתב אישום. חלק מהתלונות, כך נטען "הולך לאיבוד" וחלקו לא נחקר כלל.
עפ"י הודעת מועצת יש"ע וארגון זכויות האדם ביש"ע אין מדובר בכשלון חקירתי כטענת ארגון השמאל, אלא בפתיחת תיקים בלתי הגיונית שהמניע שלה פוליטי, וכתוצאה גם נסגרים התיקים.
דוברת מועצת יש"ע אמילי עמרוסי אומרת לערוץ 7 כי מועצת יש"ע עוסקת בנסיון למנוע את הרדיפה הפוליטית של המתיישבים על ידי פעילות פרלמנטרית וכן על ידי הידברות עם גורמי שב"כ ומשטרה. הקושי טמון לדבריה בעובדה כי הפרקליטות ומוסדות אכיפת החוק נתונים לשליטת אנשי שמאל התומכים בפתיחת התיקים ובהתנכלות הפוליטית לתושבי יש"ע.
יו"ר ארגון זכויות האדם ביש"ע אורית סטרוק אומרת כי "מימצאי הארגון האנטישמי יש דין אינם מצביעים על רמת אכיפה נמוכה נגד מתיישבי יש"ע אלא להיפך. סגירת התיקים הסיטונאית היא תוצאה הכרחית של פתיחת תיקים סיטונאית שהיא פועל יוצא של אכיפת יתר ולא של תת אכיפה" לדבריה כל קרימינולוג מתחיל יודע שהנתון הקובע לגבי רמת אכיפת חוק הוא אחוז הגילוי. "מנתונים שמסרה המשטרה לבג"ץ עולה כי אחוז הגילוי בתיקים נגד מתנחלים הם הגבוהים בארץ – 70% . וזאת כיון שהמשאבים החקירתיים והמשטרתיים המושקעים באכיפה על המתנחלים הם מהגבוהים במשטרת ישראל. נתון זה הוא אבסורדי אל מול אחוזי הפשיעה הנמוכים באזורנו, ומעיד על אכיפה פוליטית הבאה על חשבון זכויות האדם של מתיישבי יש"ע".
גם משטרת מחוז ש"י הגיבה לטענות אנשי הארגון. בין היתר נאמר בתגובה כי "ישנם מקרים לא מעטים בהם נדרשים עדים מקומיים לגשת ולמסור עדויות בתחנת המשטרה אך הם מסרבים והדבר אכן פוגע בחקירה". עוד נאמר בתגובה כי "לא אחת נדרשו המתלוננים להופיע למתן עדות בבית המשפט ומכיון שלא הופיעו נאלצה התביעה לחזור בה מכתב האישום. ישנם מקרים לא מעטים שמשטרת ש"י דואגת אף להסיע עדים פלסטינים משטחי אי לבית המשפט בישראל לשם מסירת עדות וזאת על חשבון פעילות מבצעית בכדי להקל על התביעה/ הפרקליטות בניהול התיק וסיום הליכים אפקטיביים נגד נאשמים ישראליים".
משטרת ש"י מוסיפה ומציינת כי "ישנם מקומות בהם הגישה מצריכה תיאום וליווי ואבטחה וישנם עדיין גורמים בשטח המעונינים לפגוע בנו, דבר שגורם להשהות ביצוע פעולות חקירה פשוטות ואלמנטריות. נחקרים משני הצדדים אינם משתפים פעולה וישנן בעיות קשות באשר להוכחת בעלות על שטח אדמה וזאת מכיון ורוב השטח אינו מוסדר כחוק".
יצויין כי ארגון יש דין הוקם בין היתר על ידי חברת מחסום ווטש דליה גולומב, בתו של מפקד ההגנה אליהו גולומב ואחייניתו של משה שרת. כמו כן על ידי דינה גור נכדתו של הסופר משה סמילנסקי. הארגון מלווה משפטית על ידי היועץ המשפטי של האגודה לזכויות האזרח עו"ד מיכאל ספרד.
על חברי המועצה הציבורית של "יש דין" נמנים בין היתר: יו"ר מרץ לשעבר שולמית אלוני, בעבר היועץ המשפטי לממשלה מיכאל בן יאיר הידוע בשל הנחיותיו לאכיפה מיוחדת על תושבי יש"ע, ראש עירית תל אביב לשעבר שלמה להט צ'יץ - חבר "קרן לשיתוף פעולה כלכלי" שעל חבריה נמנים גם יוסי ביילין. קרן זו עמדה מאחורי היוזמה למגעים לקראת הסכמי אוסלו.
דליה גולומב, רות קדר ודינה גור התראיינו על פעילותן ב"יש דין" לעתון הארץ באפריל 05. בין היתר אמרו כי 'הן משתמשות בלי מעצורים בקשרים אישיים'. "יש לנו רשת גדולה של היכרויות גם אנשי צבא ומשטרה, אנחנו יכולות להרים טלפון להמון אנשים".