המשרד לשירותי דת מגביר את הפיקוח על הרבנים - ומפרסם חוזר המגדיר לראשונה את תפקיד רבני היישובים והמועצות האזוריות, ומחייב אותם, לראשונה, למלא דו"ח נוכחות ובו פירוט פעילותם.
בעקבות כך יצאו הרבנים למאבק בסגן השר, הרב אלי בן דהן, שאחראי להנחיות החדשות, ומאשימים אותו כי הוא פוגע בזכויותיהם.
בחוזר המנכ"ל נכתב, כי "מסגרת תפקידם של 'המשרתים בקודש', ובייחוד של הרבנים, לא הוגדרה עד כה, ומשכך דרישות התפקיד היו נתונות לפרשנויות כאלו ואחרות".
החוזר החדש קובע בעקבות כך, כי הרב יהווה "הנהגה רוחנית המכוונת למגזרים השונים בקהילה" – זאת בנוסף לשרותי הדת ה"טכניים" שעליו להעניק להם. פעילותו של הרב תעמוד תחת פיקוח מידי שלושה חודשים.
ועדה שהוקמה במשרד המשפטים בראשות עו"ד הראל גולדברג, פרסמה את המלצותיה כבר בשנת 2008, אך הרבנים התנגדו להגברת הפיקוח עליהם - והן לא יושמו.
כעת מחיל סגן השר בן-דהן את הכללים החדשים על רבני ההתיישבות, לאחר משא ומתן ממושך של שנים. ההנחיות אינן נוגעות לרבני עיר, שכן אלה נבחרי ציבור ולא ניתן לחייבם במתן דין וחשבון על נוכחותם ופעילותם, בדומה לנבחרי ציבור אחרים כמו ראשי ערים.
על פי ההגדות החדשות, רב היישוב או המועצה ישתתף ברוב התפילות המתקיימות באחד מבתי הכנסת ביישוב, יארגן שיעורי תורה ופעילויות תורניות, יערוך חופות, יבקר חולים וילווה את בני הקהילה במעגלי החיים: השתתפות בבריתות, חתונות, מסיבות בר ובת מצווה, לוויות, ניחום אבלים ואזכרות, ואף עריכת חלק מאותם טקסים – כל עוד הם מתקיימים במרחק של 35 ק"מ לכל היותר ממקום הכהונה.
עוד מהגדרות התפקיד החדשות של הרב: השתתפות באירועים ציבוריים ואירועים חינוכיים המתקיימים ביישוב, ונוכחות בו לפחות שלושה שבתות בחודש (מעבר לכך, ייחשב לרב כימי חופשה) וברוב מועדי ישראל. "על הרב להיות זמין לבני קהילתו הן באופן פיזי בעיקר בשעות הערב, שבתות ומועדי ישראל, והן בטלפון סלולארי", נקבע בחוזר.
כל רב בהתיישבות, מצדו, יעביר לוועדה שתפקח על העניין דיווח רבעוני, באמצעות טופס קבוע של המשרד לשרותי דת, ובו פירוט אודות פעילותו - כתנאי להמשך תקצוב שכרו.
הרבנים מצידם, מתנגדים למהלך על אף המשא ומתן הממושך עימם.
מינויים של רבני ההתיישבות נעצר בזמן שפורק משרד הדתות בשנת 2004 ותקנים לרבנים חדשים הוקפאו בצו ביניים.
בעקבות ההנחיות החדשות, פנה יו"ר ארגון רבני ההתיישבות, הרב יוסף שלוש, המכהן כרב האזורי של דרום השרון, ואמר כי חוזר המנכ"ל "חמור מכל ופוגע ברבני ישראל, במעמד הרבנות בישראל".
הרב שלוש ניצל את ההזדמנות לתקוף את סגן שר הדתות, שאינו מצליח לעצור את גל החקיקה בענייני דת ומדינה, ולפעמים אף מוביל בעצמו חלק מהצעות החוק, וכתב: "כל גדולי הרבנים ותלמידי החכמים של הציונות הדתית יצאו נחרצות נגד כל המעשים והמגמות המסוכנות הנזכרות לעיל. הבעיה העיקרית היא שהראשים שבידם הסמכות לא שומעים לרבנים כלל ועיקר".
סגן השר טרם השיב להאשמותיו של הרב שלוש, אך מקורבים לסגן השר מוסרים כי נראה סביר שסגן השר ימשיך לשפר, להנגיש ולייעל את שירותי הדת ככל יכולתו.