לאחר סיום נתיחת גופתו של מנהיג חמאס יחיא סינוואר שחוסל ברפיח היא הועברה לאחסון במיקום סודי.
הנתיחה והבדיקות נערכו במכון לרפואה משפטית באבו כביר לשם הובאה אמש הגופה. הגופה צפויה לשמש ככל הנראה את ישראל כקלף מיקוח במשא ומתן לשחרור חטופים.
מנתיחת הגופה עולה כי ירי מרובה בראש גרם למותו של המחבל סינוואר. עוד עולה כי על גופתו נמצאו סימני ירי, בין היתר של פגזים.
משקל גופו היה תקין, כשבעים ק"ג. טרם התקבלו תוצאות של בדיקה טוקסיקולוגית שעשויה להעיד על הימצאות של סמים או חומרים אחרים בדמו של סינוואר.
לפי התחקיר הראשוני על חיסולו של סינוואר, ביום רביעי בשעה 10:00 בבוקר לוחם מגדוד 450 זיהה דמות חשודה יוצאת ונכנסת למבנה ברפיח. הכוחות הפעילו אש על הבניין.
בשעה 15:00 הכוחות זיהו באמצעות רחפן שלוש דמויות יוצאות ועוברות בין בתים. שניים מהם היו מכוסים בשמיכות, ככל הנראה הם הלכו לפני סינוואר כדי לפתוח לו את השטח.
הלוחמים ירו לעבר המחבלים שנפצעו והתחילו להתפזר. שניים נכנסו למבנה אחד וסינוואר נכנס למבנה אחר. טנק ירה על המבנה בו הסתתרו המחבלים. סינוואר היה לבדו במבנה אחר. הוא עלה לקומה השנייה בבניין. הטנק ירה פגזים גם על המבנה הזה, ולוחמים השליכו אליו שני רימונים.
מפעיל הרחפן ראה דמות פצועה ביד ורעולת פנים יושבת בחדר. הדמות ראתה שהרחפן מתקרב אליה, ולקחה חתיכת עץ וזרקה עליו. פגז נוסף נורה על המבנה.
למחרת בבוקר נכנסו למבנה כוחות צה"ל וכשבדקו את הגופה הם ראו את דמיון לסינוואר.