משרד החוץ של הרשות הפלסטינית מגנה את "פשע מעשה הטבח בבית הספר אל-תאביעין" ומטיל את האשמה על הקהילה הבינלאומית ומוסדותיה, ובכללה זה מועצת הביטחון של האו"ם, בגין אזלת ידם להביא להפסקת "מלחמת ההשמדה" נגד העם הפלסטיני.
דובר צה"ל מסר, כי תקיפת מתחם בית הספר בוצעה בהתאם למידע מודיעיני לפיו כעשרים מחבלים, ובהם מפקדים בכירים, פעלו בבית הספר והשתמשו בו כבסיס לביצוע פיגועי טרור. עוד נמסר, כי המתחם, ובו המסגד שהותקף, היה מתחם פעיל של חמאס והג’יהאד האיסלאמי.
משרד החוץ הפלסטיני ציין, כי "הכיבוש הישראלי הבלתי חוקי הוא כיבוש שאין לו כל קשר לאנושיות, וחובה למצות איתו את הדין ולהענישו על פשעיו, וכן למצות את הדין ולהעניש את כל המדינות והגורמים השותפים לביצוע כל הפשעים הללו".
לטענת משרד החוץ הפלסטיני, בתקיפת בית הספר נהרגו יותר ממאה פלסטינים ונפצעו מאות, והיא מלמדת כי מתן חסינות לישראל מפני עונש מעודדת אותה להמשיך ולבצע "מעשי טבח באדמה הפלסטינית הכבושה".
בהודעה שפרסם דרש משרד החוץ הפלסטיני מבית הדין הפלילי הבינלאומי להוציא צווי מעצר נגד "פושעי המלחמה" הישראלים (נגד רה"מ נתניהו ושר הביטחון גלנט) כדי להרתיע את ישראל ולמנוע ביצוע של "פשעים" נוספים.