במבצע לילי של סיירת צנחנים, ימ"ר ש"י וכוחות צה''ל מחטיבת מנשה נלכד ונעצר במחנה הפליטים טול כרם השוטר הפלסטיני עלאא קואטו, שתכנן להתנקש בראש המועצה האזורית שומרון יוסי דגן.
במהלך המבצע פתחו מחבלים בירי מאסיבי על רכבי הלוחמים ואף השליכו לעברם מטעני חבלה. המחבל הודה בחקירה כי תכנן להתנקש בחייו של דגן ולבצע פיגועי ירי בצירים מרכזיים. הוא היה מבוקש במשך כארבעה חודשים בעקבות כוונתו לפגוע בראש המועצה.
לפני מספר חודשים פשטו כוחות הביטחון על בית משפחתו של קואטו, אולם הוא לא נתפס. מאז, במשך תקופה, הסתתר המחבל המבוקש ביריחו, ככל הנראה במתקן של המשטרה הפלסטינית ובסיוע הרשות הפלסטינית.
משהרגיש כי הטבעת מתהדקת עליו, הוא עבר להסתתר במחנה הפליטים בטול-כרם, מתוך מחשבה כי צה"ל יירתע מללכוד אותו שם.
במהלך המבצע ללכידתו התנהלו חילופי אש בין לוחמי מערכת הביטחון לבין חוליית מחבלים ואף נזרקו על הכוחות מטעני חבלה.
דגן הגיב לתפיסת המחבל ואמר: "אני מודה לכוחות הביטחון, לימ"ר ש"י, לסיירת הצנחנים, לשב"כ ולחטיבת מנשה. יחד עם כל עם ישראל אני מחזק את מערכת הביטחון בהשבת הביטחון והכבוד הלאומי של עם ישראל.
אישית, אני לא שונה מאף אזרח אחר - מי שביקש לפגוע בי מבקש לפגוע בכל אזרחי מדינת ישראל ובכל מקום ברחבי המדינה. אנחנו יהודים מאמינים, לעולם לא נחשוש ולעולם לא נירתע. האיומים הללו רק מחזקים אותי לבנות את השומרון, וארץ ישראל עוד יותר".
רק לפני כשבוע הוכרז דגן שוב כאישיות מאוימת בדרגה הגבוהה ביותר - דרגה 6 - והוצמדו לו מאבטחים חמושים צמודים וכן הופקדה שמירה חמושה על ביתו 24 שעות ביממה סביב ביתו, זאת בפעם השלישית בשנתיים האחרונות.
הגברת האבטחה הגיעה לאחר שארגון הטרור "כוחות הגליל - זאבים בודדים", שמקורו במחנות הפליטים הפלסטינים בסוריה ומקושר לארגון החיזבאללה, פרסם ברשתות החברתיות הפלסטיניות סירטון בו הוא נשבע כי ירצח את ראש מועצת שומרון.
הסירטון והקריאה להתנקשות בחייו פורסמו לאחר ההספד אותו נשא דגן בהלוויתו של נרצח הפיגוע סמוך לחרמש מאיר תמרי הי"ד. בהספד אמר ראש המועצה: "גם אם נצטרך ללעוס את הסלעים ניאחז בשומרון". בתגובה פרסם ארגון הטרור, העומד מאחורי הפיגוע בצומת מגידו, בסרטון ובהודעה רשמית: "יוסי דגן, אתה נשבע לאכול סלעים. נשבעים שאתה תמות כמו שימות חזירים - הו חזיר של שבת - מותך קרוב בשומרון. הדייט (התאריך) שלך קרוב. אתה תישרף בשומרון".