חבר הכנסת והרמטכ"ל לשעבר גדי איזנקוט תוקף בחריפות את שר הביטחון וטוען כי כי בשל חולשה פוליטית הוא "נותן לצבא פקודות בניגוד לחוק".
איזנקוט יצא נגד הסרת המחסומים שאיפשרו את הקמת הישיבה בחומש ואי פינוי מאחזים בראיון לכאן רשת ב'.
לדעתו, "ראש הממשלה בנימין נתניהו "רסק את המערכת הביטחונית ביו"ש בגלל צרכים פוליטיים, ובכך צה"ל נקרע בין חובתו לספק ביטחון לבין שמירה על חוק".
הוא התייחס להתבטאויות של חברי כנסת נגד אלוף פיקוד מרכז יהודה פוקס ואמר: "הוא מפקד מצויין. תושבי הדרום חבים לו. זו רוח המפקד ומגמה בה צה"ל נדחק מהקונצנזוס. פעם שוליים קיצוניים ביקרו את מפקדי פיקוד מרכז – היום זה השלטון. הפוליטיקאים בורחים מאחריות ומשאירים את צה"ל לבד".
כאשר נשאל לדעתו על אמירותיו של מזכיר הממשלה בנוגע לעיגון בחוק יסוד את פטור הגיוס לחרדים השיב: "זה ליקוי מאורות, פגיעה אנושה בצה"ל – צבא העם. איוולת בקנה מידה היסטורי ופגיעה עתידית במילואים. מקווה שנראה חברי כנסת מהליכוד והציונות הדתית שימנעו את זה, הייתי מצפה מהם לצאת באמירה נחרצת".