בעקבות הפיגוע הרצחני בוושינגטון החליט שר החוץ גדעון סער להוריד את דגלי ישראל לחצי התורן במשרד החוץ ובנציגויות ברחבי העולם.
סער התייחס בהצהרה להירצחם של ירון לישינסקי ובת זוגו שרה מילגרם ואמר כי "שוחחתי הבוקר עם דניאל, אביו של ירון, ואמרתי לו שבנו היה לוחם במערכה המדינית ונפל כפי שנופל חייל בחזית הקרב. תנחומיי למשפחותיהם ועובדי השגרירות בוושינגטון".
"זו התוצאה הישירה של הסתה אנטישמית, ארסית ורעילה שמתנהלת נגד ישראל והיהודים ברחבי העולם מאז ה-7 באוקטובר, ושכמותו לא היה מעולם", הוסיף.
עוד אמר כי "בתקופה האחרונה אנו עדים לגל, שלא היה כמותו, של פיגועים וניסיונות לפיגועים נגד נציגויות ישראל בעולם, בדגש על אירופה. נציגויות ישראל ונציגי ישראל ברחבי העולם הם מטרה לטרור אנטישמי שחוצה את כל הקווים האדומים. כל החודשים האחרונים חרדתי שדבר כזה יקרה. וזה קרה, רשימת הנופלים התארכה היום".
אנחנו במשרד החוץ וכל נציגויות ישראל בעולם נוריד את הדגל לחצי התורן בעקבות רצח העובדים שלנו. אני גאה לעמוד בראש המערכת הזאת – הם מזוהים ומסמלים את המדינה, הם סופגים התקפות ומילים קשות ורעילות – והיום 2 מהם ספגו את כדורי הטרוריסט". "קו ישיר מחבר בין ההסתה האנטישמית לרצח הזה. ההסתה הזאת כוללת גם דוברים רשמיים של מדינות רבות ושל ארגונים בינלאומיים, ובפרט באירופה. המילים, שהן עלילות הדם המודרניות, המופצות נגדנו על ג׳נוסייד כביכול, פשעים נגד האנושות והריגת תינוקות, הן מכשירות את הדרך למעשי הרצח האלה. זו האווירה בעולם שהפכה דם יהודי וישראלי להפקר".
הפיגוע התרחש במהלך אירוע של ארגון יהודי אמריקני. החשוד בירי, אליאס רודריגז בן 30 משיקגו, נתפס. על פי דיווחים הוא צעק "לשחרר את פלסטין" במהלך מעצרו.
מנכ"ל משרד החוץ עדן בר טל שיגר מכתב לכלל עובדי המשרד בארץ ובעולם וכתב: "היום הוא יום קשה מנשוא למשפחת משרד החוץ. הזדעזענו כולנו למשמע הפיגוע הנורא בו נרצחו שניים מעובדי השגרירות בוושינגטון, ירון לישינסקי ושרה מילגרים. העין דומעת והלב כואב את הירצחם של שני צעירים מוכשרים ונפלאים, אשר היו בתחילת חייהם המשותפים. אתם לא לבד - אנחנו כאן כדי לתמוך ולחזק ככל שיידרש".
"זוהי תזכורת לכך שמלחמתנו אינה מתמצה רק בשדה הקרב הפיזי - אלא גם בזירה התודעתית, הערכית והמדינית", כתב. "עבודתכם - על אף העומס והסכנות - נושאת משמעות אדירה לעתיד העם והמדינה".