בית הדין הרבני האזורי בירושלים פסק כי הסמכות המשפטית והמינהלית על קבר יוסף בשכם תועבר לשני רבנים, שעומדים בראש ארגון "שכם אחד", המארגן בשנים האחרונות ביקורים באתר שלא באישור צה"ל. זאת על אף שהאתר נמצא במובלעת בעלת מעמד מיוחד בלבה של שכם, באזור A, שעל פי הסכם הביניים (אוסלו ב') נתון לאחריותה המלאה של הרשות הפלסטינית. כזכור, הצדדים התחייבו בהסכם להימנע מכל שינוי בסטטוס-קוו בשטחים עד לחתימה על הסכם הקבע.
אב בית הדין, הרב חיים ש. רוזנטל, החליט כי הרבנים שלמה בן שמעון ומרדכי גרוס הם "באי הכוח והנציגים הרשאים להופיע מבחינה משפטית וציבורית בפני כל ערכאה ומוסד לצורך ענייני ההקדש כפי שייראה בעיניהם". השניים עתרו בדרישה להכיר בהם כאפוטרופוסים החוקיים והבלעדיים של האתר, וכתבו כי "רשויות הצבא" הן שדרשו מהם להקים "גוף חוקי שינהל, יתפעל וישגיח על המקום הקדוש" כדי להגדיל את מספר המבקרים. בית הדין נענה לעתירה ונתן לשניים את מבוקשם - סמכות לנהל באופן שוטף את האתר, הכוללת לכאורה גם אישור סיורי מתפללים יהודים.
בית הדין אישר גם את מינויים של באי כוחם של הרבנים - חסיד ברסלב, נתנאל שניר, מראשי "שכם אחד", יואל פרץ, ויעקב לוי למנהלי ההקדש בפועל. בנובמבר 2010 צוטט שניר באתר "הקול היהודי": "מלבד מהכניסות הלא סדירות, מדי ראש חודש היינו מבקשים אישור כניסה לקבוצה בראשות הרב גולן מור יוסף. המח"ט דאז מעולם לא אישר את הכניסות, כך שנכנסנו גם ללא אישור הצבא. תמיד חתרנו לעבודה בשיתוף פעולה, אך אם זה לא היה קורה היינו ממשיכים בשלנו". בדיווח נכתב כי "לשניר ברור שהתפילות על ציון יוסף הצדיק אינן מהוות מטרה שלמה וכי כמובן שהשאיפה היא לחזור ליוסף ולשכם עיר הברית, להתיישב בה ולנחול את הארץ".
דובר צה"ל מסר ל"הארץ" כי הטענה שהרבנים הם מעתה והלאה "בעלי הבית" של האתר שגויה. "הטענה בדבר הפניה המדוברת איננה נכונה. הכניסה לקבר יוסף מתואמת על ידי המינהל האזרחי ומסודרת על ידי משטרת ישראל, תוך תיאום עם גורמים רבניים, בהם הרבנים המדוברים, וגורמי הרשות הפלסטינית, על מנת לאפשר חופש פולחן דת", נמסר.
